Молекуларна дестилацијае специјална технологија за одвојување течност-течност, која се разликува од традиционалната дестилација која се потпира на принципот на раздвојување на разликата во точката на вриење. Ова е процес на дестилација и прочистување на материјал чувствителен на топлина или материјал со висока точка на вриење користејќи ја разликата во слободниот пат на молекуларно движење под висок вакуум. Главно се користи во хемиски, фармацевтски, петрохемиски, зачини, пластика и нафта и други индустриски полиња.
Материјалот се пренесува од садот за хранење до главниот испарувач со обвивка за дестилација. Преку ротација на роторот и континуирано загревање, течноста од материјалот се струга во исклучително тенок, турбулентен течен филм и се турка надолу во спирална форма. Во процесот на спуштање, полесниот материјал (со ниска точка на вриење) во материјалната течност почнува да испарува, се движи до внатрешниот кондензатор и станува течност што тече надолу кон колбата за примање на лесната фаза. Потешките материјали (како хлорофил, соли, шеќери, восочни итн.) не испаруваат, наместо тоа, тече по внатрешниот ѕид на главниот испарувач во колбата за примање тешка фаза.